Кафедра была основана в 1929 году в составе Самаркандского сельскохозяйственного института. В разные периоды своего развития она носила различные названия: в 1989–2004 годах — «Хирургия и фармакология», в 2004–2017 годах — «Анатомия, физиология, хирургия и фармакология животных», в 2017–2018 годах — «Ветеринарная хирургия, фармакология и токсикология», в 2018–2019 годах в составе Самаркандского института ветеринарной медицины — «Фармакология, токсикология, ветеринарно-санитарная экспертиза и гигиена», в 2020–2021 годах — «Фармакология и токсикология». С 2022 года она функционирует в составе Самаркандского государственного университета ветеринарной медицины, животноводства и биотехнологий под названием «Фармакология и токсикология».
В настоящее время кафедрой руководит доктор ветеринарных наук, профессор Ю. Салимов. В состав кафедры входят доктора философии (PhD) в области ветеринарных наук Т.Т. Хатамов, О.Э. Нематуллаев, А.Т. Ибрагимов, а также ассистенты М.А. Шарапов, Л.Н. Халилов, А.З. Сойибов, Н.Дж. Хужаева, заведующая лабораторией К.С. Буранова и лаборанты О.Р. Яркулова и Н.Х. Яхшиева.
Ведущие преподаватели кафедры принимали участие в международном проекте «Twinning Program» в сотрудничестве с Университетом Миннесоты (США) на 2020–2024 годы.
Преподаватели кафедры прошли стажировки в ряде ведущих зарубежных высших учебных заведений, проводили вебинары и читали лекции как в офлайн, так и в онлайн-формате.